O Museu de Arqueologia da Boa Vista, inaugurado em 08 de junho de 2023, é o resultado final de uma longa jornada de recolha e tratamento de artefactos arqueológicos terrestres e subaquáticos realizados na ilha da Boa Vista nos anos 90 e 2000, nomeadamente as escavações arqueológicas realizadas entre 1992 e 2002, e as escavações realizadas nas ruínas do Forte Duque de Bragança em 1994-1995 e 2019.
O Museu de Arqueologia da Boa Vista está instalado num edifício do século XX onde funcionou outrora a antiga Alfândega datada de 1840.
O edifício inventariado como Património Nacional foi transferido do Património do Estado para a Ministério da Cultura e das Indústrias Criativas, no quadro do Programa de Reconversão Patrimonial, com vista à sua reabilitação e adequação enquanto estrutura museológica, no âmbito do Plano Operacional do Turismo (POT) – Cabo Verde, sendo Co-financiado pelo projeto Margullar II, do Programa MAC 2014-2020, financiado pela União Europeia, a BUREAU da UNESCO Dakar e pela Câmara Municipal da Boa Vista.
O espólio do museu é formado essencialmente por artefactos provenientes de 5 navios naufragados na ilha da Boa Vista, Leijmudeen (1770), Hartwell (1787), Lady Burgess (1806), Varandinha (desconhecido) e Santo André (1856), nomeadamente peças de estrutura de navio, materiais bélicos, moedas variadas, assessórios de uso pessoal, cerâmica, utensílios de cozinha, objetos que representam a vida a bordo das embarcações, e artefactos encontrados no Forte Duque de Bragança.
