O Museu foi inaugurado no dia 27 de novembro de 1997 para albergar o espólio etnográfico recolhido pelo então Instituto Nacional da Cultura (INAC), durante os anos de 1992 a 1995, nas ilhas de Santiago, Santo Antão, Boavista e Brava.
Fica situado na rua 5 de julho, atual rua Pedonal no Plateau.